依田　芳卓（Yoshitaka Yoda）

プロフィール
回折・散乱IIグループ・量子状態解析チーム

主幹研究員

メール： yoda＠spring8.or.jp


原子核の共鳴準位による散乱である核共鳴散乱はエネルギー幅がμeV以下の超単色であるという特徴をもっています。その特性を活かした放射光メスバウアー分光や核共鳴振動分光などを利用した研究を支援するため、研究開発・装置開発・実験のサポートや共同研究を行っています。高い時間分解能をもつAPD検出器やさまざまな試料環境を整備するとともに、これまで10を越える高分解能モノクロメータの設計・製作をおこなってきました。最近では酵素の活性中心の働きを調べるのにユニークな特徴をもつ核共鳴振動分光法を多くのの化学・生物研究者に利用いただくことにも注力しています。


外部機関所属先

  • 理化学研究所　客員研究員

キーワード

  • 核共鳴散乱
  • 高分解能モノクロメータ
  • 核共鳴振動分光
研究成果

研究論文

  • “Terminal Hydride Species in [FeFe]-Hydrogenases Are Vibrationally Coupled to the Active Site Environment.”,C. C. Pham, D. W. Mulder, V. Pelmenschikov, P. W. King, M. W. Ratzloff, H. Wang, N. Mishra, E. E. Alp, J. Zhao, M. Y. Hu, K. Tamasaku, Y. Yoda, and S. P. Cramer, Angew. Chemie Int. Ed., 57 (2018) 10605–10609
  • “Structural Relaxation and Viscoelasticity of a Higher Alcohol with Mesoscopic Structure.”, T. Yamaguchi, M. Saito, K. Yoshida, T. Yamaguchi, Y. Yoda, and M. Seto, J. Phys. Chem. Lett., 9 (2018) 298–301
  • “High-resolution monochromator for iron nuclear resonance vibrational spectroscopy of biological samples.”, Y. Yoda, K. Okada, H. Wang, S. P. Cramer and M. Seto, Jpn. J. Appl. Phys., 55 (2016) 122401
  • “Oxidation states and quality of upper interfaces in magnetic tunnel junctions: oxygen effect on crystallization of interfaces.”, S. Kamali, C.L. Zha, Y. Yoda and J. Åkerman, Journal of Physics Condensed Matter, 26 (2014) 026004
  • “Elucidation of the Fe(IV)=O intermediate in the catalytic cycle of the halogenase SyrB2”, S. D. Wong, M. Srnec, M. L. Matthews, L. V. Liu, Y. Kwak, K. Park, C. B. Bell, E. E. Alp, J. Zhao, Y. Yoda, S. Kitao, M. Seto, C. Krebs, J. M. Bollinger, Jr and E. I. Solomon, Nature, 499 (2013) 320-323
  • "Observation of the Fe-CN and Fe-CO vibrations in the active site of [NiFe] hydrogenase by nuclear resonance vibrational spectroscopy", S. Kamali, H. Wang, D. Mitra, H. Ogata, W. Lubitz, B.C. Manor, T.B. Rauchfuss, D. Byrne, V. Bonnefoy, F.E. Jenney Jr., M.W.W. Adams, Y. Yoda, E. Alp, J. Zhao and S.P. Cramer Angewandte Chemie International Edition, 52 (2013) 724-728
  • “Slow processes in supercooled o-terphenyl: relaxation and decoupling”, M. Saito, S. Kitao, Y. Kobayashi, M. Kurokuzu, Y. Yoda and M. Seto, Phys. Rev. Lett,. 109 (2012) 115705
  • "Upgrade of the nuclear resonant scattering beamline, BL09XU in SPring-8"" Y. Yoda, Y. Imai, H. Kobayashi, S. Goto, K. Takeshita and M. Seto Hyperfine Interactions 206 (2012) 83-86
  • “Observation of Nuclear Resonant Scattering accompanied by Phonon Excitation using Synchrotron Radiation.”, M. Seto, Y. Yoda, S. Kikuta, X. W. Zhang and M. Ando, Phys. Rev. Lett., 74 (1995) 3828

口頭発表

  • 「核共鳴振動分光装置の開発による鉄含有酵素の原子レベルでの考察」、依田芳卓、第42回日本鉄バイオサイエンス学会学術集会、金沢（2018）
  • "Nuclear Resonant Scattering Beamline at SPring-8 - Present Status, Recent Activities and Future Plan -", Y. Yoda, Invited talk in 1st Nuclear Resonant Scattering workshop in China, Beijin（2017） 
  • 「鉄原子の振動のみを抽出する新たな測定法-核共鳴振動分光法–」、第86 回日本生化学会大会、シンポジウム「生体金属が関与する細胞内クロストークの新展開」にて招待講演、依田芳卓、横浜（2013）

書籍・雑誌

  • 「核共鳴振動分光の生物学分野への応用　–酵素活性中心のプローブとして-」, 依田芳卓, 放射光, 5月号 (2016) 150-157
  • 「放射光による核共鳴散乱 –放射光メスバウアー分光と核共鳴振動分光-」, 依田芳卓, Radioisotopes, 63 (2014) 317-329
  • “Synchrotron Radiation Based Nuclear Resonant Scattering: Applications to Bioinorganic Chemistry”, Y. Guo, Y. Yoda, X. Zhang, Y. Xiao and S. P. Cramer Mossbauer Spectroscopy: Applications in Chemistry, Biology, Industry, and Nanotechnology, (2013) Chapter 12, Wiley, V. K. Sharma, G. Klingelhofer and T. Nishida (Eds,)
  • “A Practical Guide for Nuclear Resonance Vibrational Spectroscopy (NRVS) of Biochemical Samples and Model Compounds”, H. Wang, E. E. Alp, Y. Yoda and S. P. Cramer, Metalloproteins (2014) Chapter 9, Springer, J.C. Fontecilla-Camps and Y. Nicolet (Eds.)

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