稲葉 理美（Satomi Inaba-Inoue）

プロフィール
回折・散乱推進室

研究員

メール：inaba＠spring8.or.jp


統合的なアプローチにより、タンパク質の構造と機能との相関解明を目指した研究を進めています。2019年10月よりJSPS海外特別研究員として、インペリアル・カレッジ・ロンドン（英国）にて抗菌ペプチドを取り込む膜タンパク質の構造や輸送機構に関する研究を行っています。

所属学会

  • 日本生物物理学会
  • 日本農芸化学会
  • 日本蛋白質科学会
  • The British Crystallographic Association (BCA), Member
  • UJA海外日本人研究者ネットワーク（キャリアディベロップメント部, 編集部）

外部機関所属先

  • 京都府立大学 生命環境学部 非常勤講師 (~ 2019.03)
  • Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University (OIST), Visiting Researcher (2017.10 ~ 2018.09)
  • Diamond Light Source, Visiting Scientist (2018.02.06 ~ 2018.03.13)
  • 日本学術振興会　海外特別研究員 (2019.10 ~ 2022.06)
  • Department of Life Sciences, Imperial College London, Sponsored Researcher (2019.10 ~ 2022.06)
  • Research Complex at Harwell, Rutherford Appleton Laboratory, Visiting Researcher (2019.10 ~ 2022.06)

キーワード

  • X線小角散乱
  • X線結晶構造解析（タンパク質）
  • 膜タンパク質
  • Cryo-EM
研究・開発成果

研究論文（査読有）

  • Ghilarov D.*, Inaba-Inoue S.*, Stepien P.*, Qu F., Michalczyk E., Pakosz Z., Nomura N., Ogasawara S., Walker G., Rebuffat S., Iwata S., Heddle J.G., Beis K. (2021), Molecular mechanism of SbmA, a promiscuous transporter exploited by antimicrobial peptides, Sci. Adv., 7 (37), eabj5363. (*equal contributors) 　　　　　　　
    Online Cover, [Press Release] JASRI, 京都大学, AMED, Imperial, RCaH, SOLARIS
    This article has been recommended in Faculty Opinions as being of special significance in its field by Faculty Member. (recommendation here)
  • Inaba S., Shiota A., Yoshida T., Oda M. (2019), Site-specific observation of the conformational change of a protein with 15N-labeled Tyr residues using NMR. Anal. Biochem., 574, 34-38.
  • Hosoe Y., Numoto N., Inaba S., Ogawa S., Morii H., Abe R., Ito N., Oda M. (2019), Structural and functional properties of swapped dimer of Grb2 SH2 in CD28 binding. Biophys. Physicobiol., 16, 80-88.
  • Inaba S., Kamiya N., Bekker G.-J., Kawai F., Oda M. (2019), Folding thermodynamics of PET-hydrolyzing enzyme Cut190 depending on Ca2+ concentration. J. Therm. Anal. Calorim., 135 (5), 2655-2663.
  • Oda M., Xi Z., Inaba S., Slack R.L., Ishima R. (2019), Binding thermodynamics of metal ions to HIV-1 ribonuclease H domain. J. Therm. Anal. Calorim., 135 (5), 2647-2653.
  • Oda M., Yamagami Y., Inaba S., Oida T., Yamamoto M., Kitajima S., Kawai F. (2018), Enzymatic hydrolysis of PET: Functional roles of three Ca2+ ions bound to a cutinase-like enzyme, Cut190*, and its engineering for improved activity, Appl. Microbiol. Biotech., 102 (23), 10067-10077.
  • Numoto N., Kamiya N., Bekker G-J., Yamagami Y., Inaba S., Ishii K., Uchiyama S., Kawai F., Ito N., Oda M. (2018), Structural dynamics of PET-degrading cutinase-like enzyme from Saccharomonospora viridis AHK190 in substrate-bound states elucidates Ca2+ driven catalytic cycle. Biochemistry, 57 (36), 5289-5300.
  • Hosoe Y.*, Inaba S.*, Sekiguchi H., Sasaki Y.C., Oda M. (2018), DNA-binding induced conformational change of c-Myb R2R3 analyzed using diffracted X-ray tracking. Biochem. Biophys. Res. Commun., 503, 338-343. (*equal contributors)
  • Shiota A., Inaba S., Oda M. (2018), Effects of active site residues of 3α-hydroxysteroid dehydrogenase from Pseudomonas sp. B-0831 on its catalysis and cofactor binding. Biosc. Biotechnol. Biochem., 82 (10), 1702-1707.
  • Oda M., Inaba S., Kamiya N., Bekker G.J., Mikami B. (2018), Structural and thermodynamic characterization of endo-1,3-β-glucanase: Insights into the substrate recognition mechanism. BBA - Proteins and Proteomics, 1866 (3), 415-425.
  • Inaba S., Fukada H., Oda M. (2018), Effect of a salt-bridge between inter-repeats on the 3D structure of the c-Myb DNA-binding domain revealed by thermodynamic analysis, J. Therm. Anal. Calorim., 131 (1), 335-341.
  • Usui D., Inaba S., Sekiguchi H., Sasaki Y.C., Tanaka T., Oda M. (2017), First observation of metal ion-induced structural fluctuations of α-helical peptides by using diffracted X-ray tracking. Biophys. Chem., 228, 81-86.
  • Usui D., Inaba S., Kamatari Y.O., Ishiguro N., Oda M. (2017), Light-chain residue 95 is critical for antigen binding and multispecificity of monoclonal antibody G2, Biochem. Biophys. Res. Commun., 490, 1205-1209.
  • Inaba S.*, Numoto N.*, Ogawa S., Morii H., Ikura T., Abe R., Ito N., Oda M. (2017), Crystal structures and thermodynamic analysis reveal distinct mechanisms of CD28 phosphopeptide binding to the SH2 domains of three adaptor proteins, J. Biol. Chem., 292 (3), 1052-1060. (*equal contributors)
  • Sato Y., Inaba S., Fukada H., Azuma T., Oda M. (2017), Pronounced effect of hapten-binding on thermal stability of an anti-(4-hydroxy-3-nitrophenyl)acetyl antibody possessing a glycine residue at position 95 of the heavy chain, Mol. Immunol., 85, 130-136.
  • Miki A., Inaba S., Maruno T., Kobayashi Y., Oda M. (2017), Tryptophan introduction can change β-glucan binding ability of the carbohydrate-binding module of end-1,3-β-glucanase, Biosc. Biotechnol. Biochem., 81 (5), 951-957.
  • Inaba S., Fukada H., Oda M. (2016), Folding thermodynamics of c-Myb DNA-binding domain in correlation with its α-helical contents, Int. J. Biol. Macromol., 82, 725-732.
  • Inaba S., Fukada H., Oda M. (2016), Thermodynamic effects of a linker region between two repeats of a protein, c-Myb R2R3, on its stability and structural dynamics, J. Therm. Anal. Calorim., 123 (3), 1763-1767.
  • Oda M., Tanabe Y., Noda M., Inaba S., Krayukhina E., Fukada H., Uchiyama S. (2016), Structural and binding properties of laminarin revealed by analytical ultracentrifugation and calorimetric analyses, Carbohydr. Res., 431, 33-38.
  • Sato Y.*, Tanaka Y.*, Inaba S., Sekiguchi H., Maruno T., Sasaki Y.C., Fukada H., Kobayashi Y., Azuma T., Oda M. (2016), Structural dynamics of a single-chain Fv antibody against (4-hydroxy-3-nitrophenyl)acetyl, Int. J. Biol. Macromol., 91, 151-157. (*equal contributors)
  • Inaba S., Maeno A., Sakurai K., Puthenpurackal S.N., Ikegami T., Akasaka K., Oda M. (2015), Functional conformer of c-Myb DNA-binding domain revealed by variable temperature studies, FEBS J., 282 (23), 4497-4514.
  • Miki A.*, Inaba S.*, Baba T., Kihira K., Fukada H., Oda M. (2015), Structural and physical properties of collagen extracted from moon jellyfish under neutral pH conditions, Biosc. Biotechnol. Biochem., 79 (10), 1603-1607. (*equal contributors)
  • Nakabayashi M., Tsukahara Y., Iwasaki-Miyamoto Y., Mihori-Shimazaki M., Yamada S., Inaba S., Oda M., Shimizu M., Makishima M., Tokiwa H., Ikura T., Ito N. (2013), Crystal structures of hereditary vitamin D-resistant rickets-associated vitamin D receptor mutants R270L and W282R bound to 1,25-dihydroxyvitamin D3 and synthetic ligands, J. Med. Chem., 56 (17), 6745-6760.
  • Inaba S., Fukada H., Ikegami T., Oda M. (2013), Thermodynamic effects of multiple protein conformations on stability and DNA binding, Arch. Biochem. Biophys., 537 (2), 225-232.

著書・総説

  • 井上（稲葉）理美：5.4.16 タンパク質とペプチドの結合（ITC）、熱量測定・熱分析ハンドブック第3版、287頁、2020年
  • 井上（稲葉）理美：5.4.27 DSCとITC－DNA結合タンパク質ー、熱量測定・熱分析ハンドブック第3版、306頁、2020年
  • 稲葉理美：生理的条件下で揺らぎの大きなDNA 結合タンパク質の機能構造解析、生物物理、57 (5)、257-258頁、2017年
  • 稲葉理美、織田昌幸：蛋白質の動的構造と機能相関解明に向けた熱力学解析、熱測定、43 (4)、126-130頁、2016年
  • 稲葉理美：フロギストン、熱測定、熱測定学会誌、43 (4)、142-143頁、2016年
  • 稲葉理美、織田昌幸：タンパク質の構造と熱物性、食品ハイドコロイドの開発と応用II－第二章　タンパク質ハイドロコロイド－、114-121頁、シーエムシー出版（2015年1月）

受賞歴

  • Apr. 2022：BCA Spring meeting 2022, BSG David Blow Prize (1st Prize), [Press Release]
  • Apr. 2022：BCA Spring meeting 2022, BSG Group Poster Prize Sponsored by Calibre Scientific
  • Nov. 2017：8th International and 10th Japan-China Joint Symposium on Calorimetry and Thermal Analysis (CATS 2017), Best Poster Award
  • 平成29年6月：日本農芸化学会関西支部優秀発表賞（支部長推薦）
  • 平成28年3月：平成27年度京都府公立大学法人等顕彰（理事長表彰）
  • 平成27年10月：第51回熱測定討論会　ポスター賞
  • 平成24年12月：Biasymposium 2012　優秀ポスター賞

競争的資金

  • 科学研究費補助金　科学研究費助成事業・基盤研究B（分担）
    期間：2022年～2024年度　（研究代表者：井上伊知郎）
  • 学術研究助成基金助成金　科学研究費助成事業・若手研究（代表）
    期間：2018年～2023年度
  • 公益財団法人ひょうご科学技術協会　学術研究助成（代表） 　　　　　　　
    期間：2018年度
  • 科学研究費補助金　科学研究費助成事業・特別研究員奨励費（代表） 　　　　　　　
    期間：2015年～2016年度

その他（フェローシップ等）

  • 2019年度　日本学術振興会　海外特別研究員　PI:Dr Konstantinos Beis 　　　　　　　
    期間：2019年10月～現在
  • 2018年　EMBO Practical Course 2018 -Solution scattering from biological macromolecules- (EMBL Hamburg) 　　　　　　　
    期間：2018年11月
  • 平成27年度　日本学術振興会　特別研究員（DC/PD） 　　　　　　　
    期間：2015年4月～2017年2月

コラム

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